การคำนวณเส้นโค้งการรอดชีพจากโมเดล Cox
ในแบบฝึกหัดนี้ เราจะทำซ้ำตัวอย่างจากวิดีโอโดยทำตามขั้นตอนต่อไปนี้:
- คำนวณโมเดล Cox
- กำหนด "ผู้ป่วยสมมติ"
- คำนวณเส้นโค้งการรอดชีพ
- สร้าง
data.frameที่เก็บข้อมูลเส้นโค้งการรอดชีพ - พล็อตกราฟ
ในแบบฝึกหัดนี้จะเน้นที่ 3 ขั้นตอนแรก ส่วน 2 ขั้นตอนถัดไปจะทำในแบบฝึกหัดถัดไป
แพ็กเกจ survival และ survminer รวมถึงข้อมูล GBSG2 ถูกโหลดไว้ให้แล้ว
แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร
Survival Analysis in R
แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำ
ลองทำแบบฝึกหัดนี้โดยเติมโค้ดตัวอย่างนี้ให้สมบูรณ์
# Cox model
cxmod <- ___(Surv(time, cens) ~ horTh + tsize, data = GBSG2)
# Imaginary patients
newdat <- expand.grid(
horTh = levels(GBSG2$___),
tsize = quantile(GBSG2$___, probs = c(0.25, 0.5, 0.75)))
___(newdat) <- letters[1:6]
# Inspect newdat
newdat