Varianța explicată

Al doilea tip de grafic folosit frecvent pentru înțelegerea modelelor PCA este scree plot-ul. Un scree plot afișează varianța explicată pe măsură ce numărul componentelor principale crește. Uneori este reprezentată și varianța cumulativă explicată.

În acest exercițiu și în cel următor, vei pregăti datele din modelul pr.out creat la începutul capitolului pentru a fi folosite într-un scree plot. Pregătirea datelor este necesară deoarece R nu dispune de o funcție predefinită pentru acest tip de grafic.

Acest exercițiu face parte din cursul

Învățare nesupervizată în R

Vezi cursul

Instrucțiuni pentru exercițiu

pr.out și datele pokemon sunt încă disponibile în spațiul tău de lucru.

Atribuie variabilei pr.var pătratul deviațiilor standard ale componentelor principale (adică varianța). Deviația standard a componentelor principale este disponibilă în componenta sdev a obiectului modelului PCA.
Atribuie variabilei pve proporția varianței explicate, calculată prin împărțirea lui pr.var la varianța totală explicată de toate componentele principale.

Exercițiu interactiv practic

Încearcă acest exercițiu completând acest cod de exemplu.

# Variability of each principal component: pr.var
pr.var <- ___

# Variance explained by each principal component: pve
pve <- ___ / ___

Editează și rulează codul