Złączenia i filtrowanie duplikatów
Do twojej sesji R została wczytana kolejna data.table – framingham – zawierająca zestaw 35 genów i ich powiązań z chorobą serca, pochodzących z badania open access Joehanes R. i in., opublikowanego w 2013 roku. Twoim celem jest porównanie wyników tego badania z wynikami każdego z twoich badań. Do sesji R zostały wczytane data.tables cardio_2 i heart_2 – przefiltrowane pod kątem brakujących wartości, ale wciąż zawierające wiele sond dla każdego genu. Wczytana została również data.table z reprodukowalnymi powiązaniami, utworzona w poprzednim ćwiczeniu – reproducible.
To ćwiczenie jest częścią kursu
Łączenie danych z data.table w R
Instrukcje do ćwiczenia
- Używając składni
data.table, wykonaj right join tabeliframinghamdoheart_2, biorąc pierwszą sondę dla każdego genu wheart_2. - Wykonaj anti-join tabeli
framinghamdoreproducible, aby sprawdzić, czy udało się znaleźć geny, które wcześniej nie były wiązane z chorobą serca.
Interaktywne ćwiczenie praktyczne
Spróbuj tego ćwiczenia, uzupełniając ten przykładowy kod.
# Right join taking the first match
___
# Anti-join
___