欠損値を含む結合
R セッションには新しい data.table が 2 つ、heart と cardio が読み込まれています。どちらも、2 つの別々の研究で心疾患と関連づけられた一連のマイクロアレイプローブを含みます。各プローブは遺伝子の発現量を測定します。1 つの遺伝子は 1 本以上のプローブで測定されることがあり、既知の遺伝子アノテーションがヒトゲノム参照配列に存在しないプローブもあります。2 つの研究では、各遺伝子を測定するために異なるプローブを用いる別々のマイクロアレイプラットフォームが使われています。あなたの目標は、両方の研究で心疾患との関連が再現された遺伝子を見つけることです。
* 注: ここでの関連はランダムに生成されたもので、実在の生物学的知見や実データを反映するものではありません。
この演習はコースの一部です
R で学ぶ data.table によるデータ結合
演習の手順
merge()関数を使い、適切な引数でエラーを回避しながらcardioをheartに対して内部結合してください。- 両方の
data.tableから遺伝子アノテーションのないプローブ（つまり、gene列が欠損している行）を削除します。 - 新しい
data.table同士で内部結合をもう一度実行し、遺伝子と心疾患の間で再現性のある関連のdata.tableを得てください。
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Try an inner join
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# Filter missing values
heart_2 <- ___
cardio_2 <- ___
# Inner join the filtered data.tables
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