重複の結合とフィルタリング
別の data.table、framingham が R セッションに読み込まれています。これは、オープンアクセスの研究［2013 年に Joehanes R. らが発表（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3684247/）］から、35 個の遺伝子と心疾患との関連をまとめたものです。ここでは、この研究結果を、あなたの各研究結果と比較することが目標です。欠損値を除外したものの、各遺伝子に対して複数のプローブを含む cardio_2 と heart_2 の data.table が R セッションに読み込まれています。前の演習で作成した再現可能な関連の data.table、reproducible も読み込まれています。
この演習はコースの一部です
R で学ぶ data.table によるデータ結合
演習の手順
data.tableの記法を使って、heart_2の各遺伝子について最初のプローブを取りつつ、framinghamをheart_2に右結合してください。- これまでに心疾患との関連が報告されていない遺伝子が見つかったかを確認するために、
framinghamをreproducibleに対してアンチ結合してください。
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Right join taking the first match
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# Anti-join
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