Randomisations de transitivité

Comme pour la longueur de chemin moyenne, examinons si la transitivité globale du réseau de Forrest Gump est significativement plus élevée que ce à quoi nous nous attendrions par hasard pour des réseaux aléatoires de même taille et densité. Vous pouvez comparer la transitivité globale de Forrest Gump à 1000 autres réseaux aléatoires.

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Analyse de réseaux avec R

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Instructions

Mille réseaux aléatoires sont stockés dans la liste gl. À l’aide de lapply() et de transitivity(), calculez la transitivité globale de chacun de ces réseaux. Affectez ces résultats à gl.tr.
Avec unlist(), convertissez gl.tr en un vecteur numérique gl.trs.
Examinez les statistiques récapitulatives des transitivités des réseaux aléatoires avec summary().
Calculez la proportion de graphes aléatoires dont la transitivité est supérieure à celle du réseau de Forrest Gump, que vous avez déjà calculée et stockée dans g.tr.

Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.

library(igraph)

# Calculate average transitivity of 1000 random graphs
gl.tr <- ___(gl, ___)
gl.trs <- ___(gl.tr)

# Get summary statistics of transitivity scores
___(gl.trs)

# Calculate the proportion of graphs with a transitivity score higher than Forrest Gump's network
mean(gl.trs > ___)

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