Joindre et filtrer les doublons
Une autre data.table, framingham, a été chargée dans votre session R. Elle contient un ensemble de 35 gènes et leurs associations avec les maladies du cœur, tirées d'une étude en libre accès par Joehanes R. et coll., publiée en 2013. Votre objectif est de comparer les résultats de cette étude aux résultats de chacune de vos études. Les data.table cardio_2 et heart_2, filtrées pour enlever les valeurs manquantes mais contenant toujours plusieurs sondes par gène, ont été chargées dans votre session R. La data.table des associations reproductibles que vous avez créée au dernier exercice, reproducible, a aussi été chargée dans votre session R.
Cette activité fait partie du cours
Jointure de données avec data.table en R
Instructions de l’exercice
- En utilisant la syntaxe
data.table, faites une jointure à droite deframinghamavecheart_2, en prenant la première sonde pour chaque gène dansheart_2. - Effectuez une anti-jointure de
framinghamavecreproduciblepour vérifier si vous avez trouvé des gènes qui n'avaient pas encore été associés aux maladies du cœur.
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Right join taking the first match
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# Anti-join
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