1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Analýza sítí v R
Connected

cvičení

Rozvržení sítí v igraph

Balíček igraph nabízí několik vestavěných algoritmů pro rozvržení sítí při jejich vizualizaci. V závislosti na velikosti dané sítě mohou různá rozvržení lépe vystihovat její strukturu. Ideální rozvržení je takové, které minimalizuje počet překřížených hran v síti. V tomto cvičení prozkoumáš několik z mnoha dostupných výchozích algoritmů rozvržení. Opakované spuštění kódu pro každý graf pokaždé vygeneruje mírně odlišnou verzi stejného typu rozvržení – několik pokusů ti může pomoci najít nejlépe vypadající vizualizaci pro tvoji síť.

Pokyny

100 XP
  • Ve funkci plot změň argument layout na layout_in_circle(), aby se síť zobrazila v kruhovém rozvržení.
  • Ve funkci plot změň argument layout na layout_with_fr(), aby se síť zobrazila s rozvržením Fruchterman-Reingold.
  • Rozvržení lze také zadat přímo jako matici souřadnic (x, y) pro každý vrchol. Použij funkci layout_as_tree() k vygenerování matice m se souřadnicemi a poté předej m parametru layout ve funkci plot().
  • Výběr správného rozvržení může být matoucí. igraph naštěstí nabízí funkci layout_nicely(), která se sama pokusí zvolit nejvhodnější algoritmus rozvržení pro daný objekt grafu. Pomocí této funkce vytvoř matici m1 a vykresli síť s použitím těchto souřadnic.