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连接并筛选重复项

您的 R 会话中已加载另一个 data.tableframingham,包含 35 个基因及其与心脏病的关联信息,来自一项开放获取研究(由 Joehanes R. 等人于 2013 年发表:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3684247/)。您的目标是将该研究的结果与您各自研究的结果进行比较。已经在您的 R 会话中加载了 cardio_2heart_2 这两个 data.table,它们已对缺失值进行了过滤,但每个基因仍包含多个探针。此外,您在上一个练习中创建的可重复关联 data.tablereproducible,也已加载到您的 R 会话中。

本练习是课程的一部分

在 R 中使用 data.table 进行数据表连接

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练习说明

  • 使用 data.table 语法,将 framingham 右连接到 heart_2,并对 heart_2 中每个基因仅取第一个探针。
  • framinghamreproducible 做反连接,查看您是否发现了此前未被报道与心脏病有关联的基因。

交互式实操练习

通过完成这段示例代码来试试这个练习。

# Right join taking the first match
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# Anti-join
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编辑并运行代码