Opcje fragmentów kodu R
W filmie poznałeś(-aś) kilka opcji fragmentów kodu R. Fragmenty kodu można też nazywać. Ma to szczególny sens w dużych dokumentach – zwłaszcza gdy wewnątrz fragmentu pojawi się błąd. Podczas renderowania dokumentu w RStudio łatwiej wtedy zlokalizować jego źródło. Niektóre fragmenty w twoim raporcie zostały już nazwane, żebyś lepiej zrozumiał(-a) ideę stojącą za tym rozwiązaniem. Opcje fragmentu dodaje się po jego nazwie i przecinku, w ten sposób: {r name, option = value}
Do najczęściej używanych opcji fragmentów kodu należą te kontrolujące wyświetlanie wyników. Domyślnie w dokumentach RMarkdown widoczne są wszystkie dane wyjściowe – komunikaty, ostrzeżenia i błędy. Określając opcje takie jak echo = FALSE, możesz ukryć sam kod R, przy czym nadal będzie on wykonywany. Więcej opcji wyświetlania znajdziesz w filmie.
Pamiętaj, aby nazwę fragmentu i jego opcje oddzielić przecinkiem – inaczej sesja może się zawiesić.
To ćwiczenie jest częścią kursu
Komunikacja danych w Tidyverse
Instrukcje do ćwiczenia
- W wierszu 14 ukryj komunikaty w pierwszym fragmencie kodu R za pomocą opcji
message, tak aby dane wyjściowe generowane czasem podczas ładowania pakietów nie były wyświetlane. - W wierszu 64 fragment
defining_a_themewzbogaca raport o niestandardowy wykres, jednak sam kod nie jest istotny dla czytelników raportu.- Ukryj cały kod, ale pozwól R go wykonać (jeśli nie pamiętasz odpowiedniej opcji fragmentu, wróć do filmu).
Interaktywne ćwiczenie praktyczne
Spróbuj tego ćwiczenia, uzupełniając ten przykładowy kod.
{"my_document.Rmd":"---\ntitle: \"The reduction in weekly working hours in Europe\" \nsubtitle: \"Looking at the development between 1996 and 2006\"\nauthor: \"Insert your name here\"\noutput: html_document\n---\n\n## Summary \n\nThe **International Labour Organization (ILO)** has many [data sets](http://www.ilo.org/global/statistics-and-databases/lang--en/index.htm) on working conditions. For example, one can look at how weekly working hours have been decreasing in many countries of the world, while monetary compensation has risen. In this report, *the reduction in weekly working hours* in European countries is analysed, and a comparison between 1996 and 2006 is made. All analysed countries have seen a decrease in weekly working hours since 1996 – some more than others.\n\n## Preparations \n\n```{r loading_packages}\nlibrary(dplyr)\nlibrary(ggplot2)\nlibrary(forcats)\n```\n\n## Analysis\n\n### Data\n\nThe herein used data can be found in the [statistics database of the ILO](http://www.ilo.org/ilostat/faces/wcnav_defaultSelection;ILOSTATCOOKIE=ZOm2Lqrr-OIuzxNGn2_08bNe9AmHQ1kUA6FydqyZJeIudFLb2Yz5!1845546174?_afrLoop=32158017365146&_afrWindowMode=0&_afrWindowId=null#!%40%40%3F_afrWindowId%3Dnull%26_afrLoop%3D32158017365146%26_afrWindowMode%3D0%26_adf.ctrl-state%3D4cwaylvi8_4). For the purpose of this course, it has been slightly preprocessed.\n\n```{r loading_data}\nload(url(\"http://s3.amazonaws.com/assets.datacamp.com/production/course_5807/datasets/ilo_data.RData\"))\n```\n\n```{r generating_summary_statistics}\n# Some summary statistics\nilo_data %>%\n group_by(year) %>%\n summarize(mean_hourly_compensation = mean(hourly_compensation),\n mean_working_hours = mean(working_hours))\n```\n\nAs can be seen from the above table, the average weekly working hours of European countries have been descreasing since 1980.\n\n### Preprocessing\n\nThe data is now filtered so it only contains the years 1996 and 2006 – a good time range for comparison. \n\n```{r}\nilo_data <- ilo_data %>%\n filter(year == \"1996\" | year == \"2006\")\n \n# Reorder country factor levels\nilo_data <- ilo_data %>%\n # Arrange data frame first, so last is always 2006\n arrange(year) %>%\n # Use the fct_reorder function inside mutate to reorder countries by working hours in 2006\n mutate(country = fct_reorder(country,\n working_hours,\n last))\n``` \n\n### Results\n\nIn the following, a plot that shows the reduction of weekly working hours from 1996 to 2006 in each country is produced.\n\nFirst, a custom theme is defined.\n\n```{r defining_a_theme}\n# Better to define your own function than to always type the same stuff\ntheme_ilo <- function(){\n theme_minimal() +\n theme(\n text = element_text(family = \"Bookman\", color = \"gray25\"),\n plot.subtitle = element_text(size = 12),\n plot.caption = element_text(color = \"gray30\"),\n plot.background = element_rect(fill = \"gray95\"),\n plot.margin = unit(c(5, 10, 5, 10), units = \"mm\")\n )\n}\n``` \n\nThen, the plot is produced. \n\n```{r}\n# Compute temporary data set for optimal label placement\nmedian_working_hours <- ilo_data %>%\n group_by(country) %>%\n summarize(median_working_hours_per_country = median(working_hours)) %>%\n ungroup()\n\n# Have a look at the structure of this data set\nstr(median_working_hours)\n\n# Plot\nggplot(ilo_data) +\n geom_path(aes(x = working_hours, y = country),\n arrow = arrow(length = unit(1.5, \"mm\"), type = \"closed\")) +\n # Add labels for values (both 1996 and 2006)\n geom_text(\n aes(x = working_hours,\n y = country,\n label = round(working_hours, 1),\n hjust = ifelse(year == \"2006\", 1.4, -0.4)\n ),\n # Change the appearance of the text\n size = 3,\n family = \"Bookman\",\n color = \"gray25\"\n ) +\n # Add labels for country\n geom_text(data = median_working_hours,\n aes(y = country,\n x = median_working_hours_per_country,\n label = country),\n vjust = 2,\n family = \"Bookman\",\n color = \"gray25\") +\n # Add titles\n labs(\n title = \"People work less in 2006 compared to 1996\",\n subtitle = \"Working hours in European countries, development since 1996\",\n caption = \"Data source: ILO, 2017\"\n ) +\n # Apply your theme \n theme_ilo() +\n # Remove axes and grids\n theme(\n axis.ticks = element_blank(),\n axis.title = element_blank(),\n axis.text = element_blank(),\n panel.grid = element_blank(),\n # Also, let's reduce the font size of the subtitle\n plot.subtitle = element_text(size = 9)\n ) +\n # Reset coordinate system\n coord_cartesian(xlim = c(25, 41))\n```\n\n\n"}