Python में .mat की संरचना

इस अभ्यास में, आप उस MATLAB dictionary की सामग्री जानेंगे जिसे आपने पिछले अभ्यास में लोड किया था.

फ़ाइल 'albeck_gene_expression.mat' पहले से ही वैरिएबल mat में लोड है. निम्नलिखित लाइब्रेरीज़ पहले से इस प्रकार import की गई हैं:

import scipy.io
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

एक बार फिर, इस फ़ाइल में UCDavis की Albeck Lab से gene expression डेटा है.

यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है

Python में डेटा आयात का परिचय

पाठ्यक्रम देखें

अभ्यास निर्देश

dictionary mat पर .keys() मेथड का उपयोग करके keys प्रिंट करें. इन keys में से अधिकतर (यानी वे जो '__' से शुरू और समाप्त नहीं होतीं) संबंधित MATLAB environment से आई variables हैं.
mat में key 'CYratioCyt' से संबंधित value का type प्रिंट करें. याद रखें, mat['CYratioCyt'] से value एक्सेस होती है.
numpy फंक्शन shape() का उपयोग करके key 'CYratioCyt' से संबंधित value का shape प्रिंट करें.
पूरा स्क्रिप्ट चलाएँ ताकि आप oscillatory gene expression डेटा देख सकें!

इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास

इस अभ्यास को इस नमूना कोड को पूरा करके आज़माएँ।

# Print the keys of the MATLAB dictionary
print(____)

# Print the type of the value corresponding to the key 'CYratioCyt'


# Print the shape of the value corresponding to the key 'CYratioCyt'


# Subset the array and plot it
data = mat['CYratioCyt'][25, 5:]
fig = plt.figure()
plt.plot(data)
plt.xlabel('time (min.)')
plt.ylabel('normalized fluorescence (measure of expression)')
plt.show()

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