Layouts de redes en igraph

El paquete igraph incluye varios algoritmos de layout integrados para visualizar redes. Según el tamaño de la red, algunos layouts pueden comunicar mejor su estructura. Idealmente, el mejor layout es el que minimiza el número de aristas que se cruzan. En este ejercicio explorarás solo unos pocos de los muchos layouts predeterminados. Volver a ejecutar el código de cada gráfico generará una versión ligeramente distinta del mismo tipo de layout. Hacerlo varias veces puede ayudarte a encontrar la visualización que mejor se vea para tu red.

Este ejercicio forma parte del curso

Análisis de redes en R

Ver curso

Instrucciones del ejercicio

En la función plot, cambia el argumento layout a layout_in_circle() para generar una red en círculo.
En la función plot, cambia el argumento layout a layout_with_fr() para generar una red con el layout de Fruchterman-Reingold.
También puedes fijar el layout proporcionando una matriz de coordenadas (x, y) para cada vértice. Aquí usarás la función layout_as_tree() para generar la matriz m de coordenadas. Luego, pasa m al argumento layout en plot() para dibujar.
Elegir el layout adecuado puede ser desconcertante. Por suerte, igraph tiene una función, layout_nicely(), que intenta escoger el layout más apropiado para un grafo dado. Usa esta función para producir la matriz m1 y dibuja la red usando esas coordenadas.

Ejercicio interactivo práctico

Prueba este ejercicio y completa el código de muestra.

library(igraph)

# Plot the graph object g1 in a circle layout
plot(g1, vertex.label.color = "black", layout = ___(g1))

# Plot the graph object g1 in a Fruchterman-Reingold layout 
plot(g1, vertex.label.color = "black", layout = ___(g1))

# Plot the graph object g1 in a Tree layout 
m <- ___(g1)
plot(g1, vertex.label.color = "black", layout = m)

# Plot the graph object g1 using igraph's chosen layout 
___ <- layout_nicely(___)
plot(___, vertex.label.color = "black", layout = ___)

Editar y ejecutar código