Úprava dendrogramu

Dendrogram máš hotový… jenže nevypadá zrovna chytlavě!

Balíček dendextend ti pomůže zaujmout publikum – umožňuje obarvit větve a vizuálně zvýraznit shluky. dendextend pracuje s objekty typu dendrogram, takže budeš muset převést hierarchický shluk z hclust pomocí as.dendrogram().

Termíny v dendrogramu si snadno prohlédneš pomocí funkce labels(), která vypíše všechny termíny. Konkrétní větve zvýrazníš funkcí branches_attr_by_labels(). Jako první předej objekt dendrogramu, pak vektor termínů jako c("data", "camp") a nakonec barvu, například "blue".

Po vytvoření grafu můžeš shluky vyznačit pomocí rect.dendrogram(), která kolem každého shluku nakreslí obdélník. Prvním argumentem je dendrogram, druhým počet shluků (k). Volitelně můžeš zadat i argument border s barvou obdélníků (např. "green").

Toto cvičení je součástí kurzu

Dolování textu metodou Bag-of-Words v R

Zobrazit kurz

Pokyny k cvičení

Balíček dendextend je již načtený a hierarchický shlukový objekt hc byl vytvořen z tweets_dist.

Vytvoř hcd jako dendrogram pomocí as.dendrogram() aplikovaného na hc.
Vypiš do konzole labels objektu hcd.
Pomocí branches_attr_by_labels() obarvi větve. Předej jí tři argumenty: objekt hcd, c("marvin", "gaye") a barvu "red". Výsledek ulož do hcd_colored.
Vykresli dendrogram hcd_colored pomocí plot() s titulkem "Better Dendrogram" zadaným přes argument main.
Přidej do grafu obdélníky pomocí rect.dendrogram(). Nastav k = 2 shluky a barvu ohraničení border na "grey50".

Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi

Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.

# Create hcd
___ <- ___(___)

# Print the labels in hcd
___(___)

# Change the branch color to red for "marvin" and "gaye"
___ <- ___(___, ___, ___)

# Plot hcd_colored
___(___, ___)

# Add cluster rectangles
___(___, ___, ___)

Upravit a spustit kód