Začněte nyníZačněte zdarma

Spojování a filtrování duplicit

Do tvé R session byla načtena další data.table s názvem framingham, která obsahuje sadu 35 genů a jejich asociace se srdečním onemocněním z otevřené studie Joehanes R. et al. publikované v roce 2013. Tvým cílem je porovnat výsledky této studie s výsledky z každé z tvých studií. Do session byly načteny data.tables cardio_2 a heart_2 filtrované pro chybějící hodnoty, ale stále obsahující více sond pro každý gen. Byla načtena také data.table reprodukovatelných asociací, kterou jsi vytvořil/a v předchozím cvičení – reproducible.

Toto cvičení je součástí kurzu

Joining Data with data.table in R

Zobrazit kurz

Pokyny k cvičení

  • Pomocí syntaxe data.table proveď pravý join tabulky framingham k tabulce heart_2 a pro každý gen v heart_2 vezmi první sondu.
  • Proveď anti-join tabulky framingham k tabulce reproducible a zjisti, jestli jsi našel/a geny, u nichž dříve nebyla pozorována asociace se srdečním onemocněním.

Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi

Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.

# Right join taking the first match
___

# Anti-join
___
Upravit a spustit kód