Spojování a filtrování duplicit
Do tvé R session byla načtena další data.table s názvem framingham, která obsahuje sadu 35 genů a jejich asociace se srdečním onemocněním z otevřené studie Joehanes R. et al. publikované v roce 2013. Tvým cílem je porovnat výsledky této studie s výsledky z každé z tvých studií. Do session byly načteny data.tables cardio_2 a heart_2 filtrované pro chybějící hodnoty, ale stále obsahující více sond pro každý gen. Byla načtena také data.table reprodukovatelných asociací, kterou jsi vytvořil/a v předchozím cvičení – reproducible.
Toto cvičení je součástí kurzu
Joining Data with data.table in R
Pokyny k cvičení
- Pomocí syntaxe
data.tableproveď pravý join tabulkyframinghamk tabulceheart_2a pro každý gen vheart_2vezmi první sondu. - Proveď anti-join tabulky
framinghamk tabulcereproduciblea zjisti, jestli jsi našel/a geny, u nichž dříve nebyla pozorována asociace se srdečním onemocněním.
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Right join taking the first match
___
# Anti-join
___