Структура .mat у Python

Тут ви з'ясуєте, що міститься в словнику MATLAB, який ви завантажили в попередній вправі.

Файл 'albeck_gene_expression.mat' уже завантажено в змінну mat. Наступні бібліотеки вже імпортовано так:

import scipy.io
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

Знову ж таки, цей файл містить дані про експресію генів з лабораторії Албека в UCDavis.

Ця вправа є частиною курсу

Вступ до імпорту даних у Python

Переглянути курс

Інструкції до вправи

Скористайтеся методом .keys() для словника mat, щоб вивести ключі. Більшість із цих ключів (тобто ті, що НЕ починаються і не закінчуються на '__') — це змінні з відповідного середовища MATLAB.
Виведіть тип значення, що відповідає ключу 'CYratioCyt' у mat. Нагадаємо, що mat['CYratioCyt'] звертається до значення.
Виведіть розмірність значення, що відповідає ключу 'CYratioCyt', за допомогою функції numpy shape().
Запустіть увесь скрипт, щоб побачити осциляторні дані про експресію генів!

Інтерактивна практична вправа

Спробуйте виконати цю вправу, доповнивши цей зразок коду.

# Print the keys of the MATLAB dictionary
print(____)

# Print the type of the value corresponding to the key 'CYratioCyt'


# Print the shape of the value corresponding to the key 'CYratioCyt'


# Subset the array and plot it
data = mat['CYratioCyt'][25, 5:]
fig = plt.figure()
plt.plot(data)
plt.xlabel('time (min.)')
plt.ylabel('normalized fluorescence (measure of expression)')
plt.show()

Редагувати та запускати код