1. Learn
    2. /
  2. Курси
    3. /
  3. Вступ до Bioconductor в R
Connected

Вправа

Скільки транскриптів?

Пригадайте з відео, як ми визначали довжини екзонів в одному з транскриптів нашого гена інтересу. Тепер ваша черга з'ясувати, скільки транскриптів має ген ABCD1. Це можна дізнатися за допомогою:

transcriptsBy(x, by = "gene")

Отримавши всі транскрипти за генами, ви можете вибрати потрібний ген за його ідентифікатором. Ідентифікатор гена ABCD1 — 215. Невелика підказка: щоб вибрати інформацію про конкретний ген, обгорніть ідентифікатор у зворотні апострофи, наприклад transcripts$`215`.

Інструкції

100 XP
  • Завантажте базу даних транскриптів людини до hg.
  • Попередньо відфільтруйте хромосому X за допомогою seqlevels().
  • Отримайте всі транскрипти в hg за "gene", збережіть результат у hg_chrXt і виведіть його.
  • Виберіть ген `215` з hg_chrXt, використовуючи $.