Дослідження якості послідовностей

Тепер ваша черга виконати перевірку контролю якості для fqsample. Це важливий крок перед подальшим аналізом, щоб швидко виявити проблеми з даними.

Щоб перевірити значення кодування для кожної літери у quality(), скористайтеся encoding():

encoding(quality(fqsample))

Для зведеної оцінки якості (QA) використайте qa():

qaSummary <- qa(fqsample, type = "fastq", lane = 1)

Об'єкт qaSummary уже створено для вас. Елементи QA можна отримати через qaSummary[["nameElement"]], де nameElement — це назва елемента, який ви хочете переглянути.

Імпортуйте ShortRead.
Перевірте якість файла послідовностей fqsample.

연습 문제

Дослідження якості послідовностей

지침 1/3

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}연습 문제

지침 1/3

연습 문제