1. Learn
    2. /
  2. Курси
    3. /
  3. Вступ до Bioconductor в R
Connected

Вправа

Поширені функції для обробки послідовностей

Дотепер ви вивчили найпоширеніші функції для обробки послідовностей:

reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()

У реальних задачах цими функціями можна опрацьовувати дуже великі послідовності.

Проте, щоб у цій вправі чітко побачити цінність і результат роботи функцій, ви використаєте невеликий піднабір. Об'єкт zikv, який ви раніше виділили з геному вірусу Зіка, містить лише 30 основ.

Інструкції

100 XP

Протестуйте функції на zikv:

  • Реверсуйте послідовність.
  • Побудуйте комплементарну послідовність.
  • Отримайте реверс-комплемент послідовності.
  • Виконайте трансляцію послідовності.