1. Learn
  2. /
  3. Курси
  4. /
  5. Аналіз диференційної експресії з limma в R

Connected

Вправа

Матриця контрастів для 3 груп

Щоб виявити гени з диференційною експресією між кожним із 3 рівнів кисню, потрібно визначити 3 попарні контрасти.

Інструкції

100 XP

Об'єкт ExpressionSet eset із даними про гіпоксію та матриця дизайну, яку ви щойно створили (design), завантажені у ваш робочий простір.

  • Використайте makeContrasts, щоб визначити 3 попарні контрасти. Пам'ятайте використовувати назви стовпців із матриці дизайну без лапок.