1. Learn
    2. /
  2. Курси
    3. /
  3. Біомедична обробка зображень у Python
Connected

Вправа

Сегментуйте серце

У цьому розділі ми працюватимемо з даними магнітно-резонансної (MR) томографії з Sunnybrook Cardiac Dataset. Повне зображення — це 3D-часовий ряд, що охоплює один серцевий цикл. Ці дані радіологи використовують, щоб вимірювати фракцію викиду: частку крові, яку лівий шлуночок виштовхує під час кожного скорочення.

Для початку сегментуйте лівий шлуночок на одному зрізі об'єму (im). Спершу ви відфільтруєте та замаскуєте зображення; потім позначите кожен об'єкт за допомогою ndi.label().

У вправах цього розділу використовуються такі імпорти:

import imageio.v2 as imageio
import numpy as np
import scipy.ndimage as ndi
import matplotlib.pyplot as plt

Інструкції 1/2

undefined XP
    1
    2
  • Застосуйте медіанний фільтр до im. Встановіть size рівним 3.
  • Створіть маску для значень, більших за 60, потім використайте ndi.binary_closing(), щоб заповнити малі отвори в масці.
  • Отримайте промаркований масив і кількість міток за допомогою ndi.label().